La primera vez que se nombró a esta tierra fue en un mapa elaborado para mostrar la Diócesis de Querétaro en el año de 1864. El nombre de San Joaquín aparece en la lista de las municipalidades y se da la órden de la construcción de la presidencia municipal por indicaciones del gobernador C. Noradino Rubio Ortíz el 3 de junio de 1941.
